PhD Student Health-economic modelling of ctDNA based colorectal cancer treatment

  • AmsterdamUMC
  • Amsterdam, Nederland
  • okt 31, 2022
Fulltime Research Data Science

Job Description

Werken bij Amsterdam UMC

PhD Student Health-economic modelling of ctDNA based colorectal cancer treatment

Wij zijn op zoek naar een enthousiaste promovendus die met behulp van statistische en gezondheidseconomische modellering de toegevoegde waarde zal evalueren van circulerend tumor DNA als biomarker voor behandelbeslissingen bij dikkedarmkanker.

Wat ga je onderzoeken?

Dikke darmkanker is een van de meest voorkomende tumortypen in Nederland. Als promovendus werk je aan twee projecten: PROVENC3 (PROgnostic Value of Early Notification by ctDNA in Colon cancer stage 3) en DOLPHIN (DNA-testing Of Liquid biopsies for Patient care close to Home In the Netherlands) die zich beide richten op de toegevoegde waarde van circulerend tumor DNA (ctDNA) om darmkanker behandeling te optimaliseren. Projectleiders zijn Dr. V Coupé, Dr. Remond Fijneman en Dr. G Vink.

Het PROVENC3-project richt zich op patiënten met stadium III darmkanker. Deze patiënten worden momenteel behandeld met chirurgie gevolgd door systemische adjuvante chemotherapie. Echter, voor 8 van elke 9 stadium III patiënten levert adjuvante chemotherapie niets op, terwijl patiënten wel de bijwerkingen ervaren. ctDNA kan mogelijk gebruikt worden om de beslissing over wie wel en wie niet te behandelen met adjuvante chemotherapie te optimaliseren. Als promovendus werk je aan werkpakket 3 van het PROVENC3 project waarbij je een wiskundig model zult maken wat de kennis omtrent ziekteproces, kosten, klinisch handelen, en kwaliteit van leven integreert. Bij de ontwikkeling van dit model worden diverse gegevensbronnen gebruikt, met name de PROVENC3 prospectieve, observationele studie naar de prognostische waarde van ctDNA testen in 300 stadium III CRC patiënten, gegevens uit het ‘Dutch Prospective Colorectal Cancer Cohort’ (PLCRC) en gegevens uit de Nationale Kankerregistratie. Multi-state time-to-event modellen zullen gebruikt worden om het progressieve ziekteproces te modelleren. Met het ontwikkelde model zal de promendus op ctDNA gebaseerde selectiestrategieën voor adjuvante chemotherapie evalueren in termen van benefits, harms en kosteneffectiviteit.

Het DOLPHIN-project richt zich op patiënten met uitgezaaid darmkanker. Deze patiënten worden momenteel gecontroleerd met CT-scans om de respons op de behandeling te bepalen. ctDNA kan een alternatief zijn voor CT-beeldvorming omdat het een indicatie is voor de hoeveelheid levensvatbare neoplastische cellen. Ons doel is het bepalen van de optimale strategie om CT-imaging aan te vullen en/of gedeeltelijk te vervangen door ctDNA-testen voor het monitoren van de behandelrespons. Als promovendus analyseer je data van een prospectieve, observationele studie waarin 400 patiënten met uitgezaaide darmkanker elke twee maanden CT-imaging en ctDNA-testen ondergaan. Met behulp van geavanceerde statistische modellering analyseer je het longitudinale patroon van gepaarde ctDNA-testen en CT-imaging data, in relatie tot de klinische uitkomst (overleving). Op basis van deze statistische analyses bouw je een beslismodel om een reeks van ctDNA-gebaseerde monitoringstrategieën te evalueren, waarbij je de langetermijneffecten van monitoring op overleving, kosten en kosteneffectiviteit voorspelt.

Wat ga je doen?

Als promovendus zijn je belangrijkste taken:

  • Een bottom-up kostenberekening om de kosten van NGS-gebaseerde ctDNA-analyse (PROVENC3) te schatten.
  • Multi-state survival modellen gebruiken om het risico op recidief en overlijden te schatten op basis van ctDNA status (PROVENC3).
  • Geavanceerde survival modellen schatten om inzicht te krijgen in het longitudinale patroon van gepaarde ctDNA-testen en CT-beeldvorming in relatie tot de algehele overleving (DOLPHIN).
  • De survival modellen integreren met gegevens over kwaliteit van leven en kosten in een gezondheidseconomisch model, afzonderlijk voor PROVENC3 en DOLPHIN, geprogrammeerd in bijvoorbeeld R-statistics of C++.
  • Het evalueren van ctDNA-gebaseerde selectiestrategieën voor adjuvante behandeling van patiënten met stadium III darmkanker (PROVENC3) en een reeks ctDNA-gebaseerde monitoring strategieën bij patiënten met uitgezaaide darmkanker (DOLPHIN) in termen van benefits, harms en kosteneffectiviteit.
  • Jouw onderzoeksresultaten publiceren in biomedische, gezondheidseconomische en/of epidemiologische tijdschriften.
  • Het schrijven van een proefschrift ter verdediging aan de Vrije Universiteit Amsterdam.
  • Assisteren bij onderwijsactiviteiten in biostatistische cursussen voor medische studenten.

Wat neem je mee?

Wij zoeken een enthousiaste promovendus met de volgende expertise:

  • MSc diploma in econometrie, toegepaste wiskunde, toegepaste statistiek, computationele biologie, gezondheidseconomie of gerelateerd veld.
  •  Programmeervaardigheden, bij voorkeur in R of C++.
  • Bewezen interesse op het gebied van biomedisch of volksgezondheidsonderzoek.
  • Goede communicatieve vaardigheden en het vermogen om te werken in een multidisciplinair team van biostatistici, epidemiologen, biologen, pathologen en gastro-enterologen.

Wat bieden we jou?

  • De aanstelling is voor de duur van de opleiding (in beginsel 4 jaar).
  • Naast een goed basissalaris krijg je onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. Bereken hier jouw netto salaris.
  • Gratis en onbeperkt toegang tot onze online leeromgeving GoodHabitz.
  • Pensioenopbouw bij het ABP, waarvan wij 70% van de premie betalen.
  • Vergoeding van 75% van je OV-reiskosten. Kom je liever op de fiets? Dan hebben we een goede fietsregeling.
  • Een actieve personeelsvereniging én Jong Amsterdam UMC vereniging, die beide leuke (sportieve) activiteiten en evenementen organiseren.

Bekijk alle arbeidsvoorwaarden van Amsterdam UMC

Wat kun je verwachten?

  • Een baan in onze prachtige hoofdstad
  • Werken bij dé favoriete werkgever in de zorg (intermediair 2021)
  • Alle collega's hebben hetzelfde doel: bijdragen aan de zorg voor morgen
  • Er is ruimte voor ontplooiing, verdieping en verbreding van je kennis
  • Een actieve personeelsvereniging die leuke activiteiten organiseert en korting op producten en diensten voor jou regelt
  • Amsterdam UMC innoveert continu, dat vraagt om een flexibele instelling van iedereen
  • Twee grote locaties, goed voor je stappenteller!
  • Je hebt meer dan 15000 collega’s die je niet allemaal persoonlijk zult leren kennen

 

Laten we kennis maken

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie kun je terecht bij Dr. Veerle Coupe via 020-4441049 of via v.coupe@amsterdamumc.nl 

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je terecht bij Chey Edwards, Recruitment Adviseur, via 06-21487245 of c.i.edwards@amsterdamumc.nl 

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Lees hier wat dit inhoudt. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag).

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.

  • Aantal uur: 36 uur per week
  • Werklocatie: Beide locaties Amsterdam UMC
  • Contractvorm: opleiding
  • Salaris: € 2.631 - € 3.336
  • Reageer tot en met: 6 november 2022

Solliciteer direct